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水箱自潔消毒器采用微電解物理消毒法對水體進行消毒。能量控制器采用循環(huán)脈沖放電控制循環(huán)釋能器向水中釋放能量，原理在于經(jīng)過水箱消毒器處理后，水中細菌和藻類的生態(tài)環(huán)境發(fā)生變化，生存條件喪失而死亡。 任何一種生物都有其特定的生存生物場。電荷在生物體內(nèi)的分布個運動，受到生物體外環(huán)境電場變化的影響，從而影響機體的生命運動。地球上的微生物一般只能適應并生存于地球表面的電場強度（130V/m）中，改變電場強度，可改變或影響細菌和藻類的生物代謝，如基因表達程序、活性等，使細菌和藻類生存環(huán)境惡化，達到殺滅細菌和藻類的目的。
水箱自潔消毒器細菌膜有許多通道。通過這些過道，細菌得以成長。這些通道是由單個分子復合體組成，能夠讓離子通過。離子通道的調節(jié)影響細菌的生命。含菌液體流過強電場，致使瞬間變化電流通過液體，在導電通路上的細胞被高速運動的電子沖擊致死，達到滅菌的目的。
水箱自潔消毒器同時由于微電解原理，通過電化學反應，使水中溶解的水分子產(chǎn)生以下強氧化性物質：臭氧（O3），活性氧（O）、等。上述氧化性物質通過擴散和循環(huán)對水箱、水池中的所有水及水箱、水池內(nèi)壁進行處理，破壞水中及水箱、水池內(nèi)壁的細菌、藻類微生物細胞，達到消毒、滅藻、仰菌的效果。
