銀離子消毒器設備(ISID)與AOT消毒是應用在建筑熱水系統中兩種不同的消毒設備，雖都是消毒設備但兩者設備屬性卻有著本質的區別。可從以下幾方面探討其差異性。
1、滅菌的持續性上
銀離子消毒器消毒為物理消毒，銀離子可穿透細菌細胞壁進入細胞內，與細胞內脫氧核糖核酸和核糖核酸相結合，破壞細菌細菌細胞內的蛋白酶與呼吸酶，從而致使細菌細胞的溶解和死亡。當細菌菌體失去活性后，部分銀離子會從菌體中游離出來，再與其他細菌接觸，滅活其他細菌，重復進行滅活作用，因此消毒效果具有持久性。
AOT消毒設備同為物理消毒，但只有水流經過設備的瞬間，水中的細菌才會被滅活，不能像銀離子那樣游離出菌體繼續滅活其他細菌，因此不具有持續性消毒特性。
2、管道壁生物膜的去除
市政輸配水系統中，水出廠經消毒后，雖然本身攜帶的初始細菌含量較少，但是在官網輸送的過程中，由于消毒效果下降，細菌在管網中繁殖，同時水中或多或少存在有機物，在輸水相互作用。表面化合反應等作用下吸附在管道壁上，逐漸形成一層營養物質較為集中的薄膜，細菌經吸附繁殖一段時間后會形成菌落和細菌群體，隨著時間推移，菌落和細菌群體連接成一片較為均勻的分布在管道內壁上形成生物膜。生物膜群落中黏附的個體和種類會不斷的增加，嚴重影響水質安全。試驗表明銀離子可少量吸附管道金屬壁上，對新建管道可抑制生物膜的形成，對老舊管道，可減少去除已形成的生物膜，從而抑制細菌的繁殖，健康用水。
AOT消毒設備對現有管道已形成的生物膜沒有去除效果。
3、消毒時間、溫度等要求
銀離子消毒器不受溫度限制，溫度越高，滅菌效果越好，其消毒作用時間大于兩小時，具有持續性消毒特性。
AOT設備消毒效果隨著溫度升高，滅菌率會逐漸降低，其為即過式消毒方式，作用時間極短，水的色度、濁度流速會影響其消毒效果，其不具有持續性消毒作用，水流過設備后還需做水質不再次被污染的措施。