硅藻土中的硅藻有許多不同的形狀，如圓盤狀、針狀、筒狀、羽狀等。松散密度為0.3～0.5g/cm3,莫氏硬度為1～1.5（硅藻骨骼微粒為4.5～5mm），孔隙率達80～90%，能吸收其本身重量1.5～4倍的水，是熱、電、聲的不良導體，熔點1650～1750°C，化學穩定性高，除溶于氫氟酸以外，不溶于任何強酸，但能溶于強堿溶液中。
硅藻土的氧化硅多數是非晶體，堿中可溶性硅酸含量為50～80%。非晶型SiO2加熱到800～1000°C時變為晶型，堿中可溶性硅酸可減少到20～30%。 1.5礦物特性 硅藻土是一種具有生物結構的巖石。主要由80～90%，有的達90%以上的硅藻殼組成。 海水、湖水中的氧化硅的主要消耗者就是硅藻，構成硅藻軟泥。在成巖過程中經石化階段形成硅藻土。 硅藻殼由蛋白石組成，硅藻在生長繁衍過程中，吸取水中膠態二氧化硅，并逐步轉變為蛋白石。
硅藻土中硅藻含量越多，雜質越少，則顏色越白，質越輕。比重一般在0.4-0.9，由于硅藻體具有眾多的殼體孔洞，使硅藻土具多孔質構造，硅藻土的孔隙度達90-92%，吸水性強烈，粘舌，由于硅藻顆粒細小，使硅藻土細膩、滑潤。硅藻土在酸中(HCl、H2S04、HN03)不溶解，但溶于HF和K0H。
硅藻是最早在地球上出現的一種單細胞藻類，生存在海水或者湖水中，形體極為微小，一般只有幾微米到十幾微米。硅藻能進行光合作用，自制有機物。常常以驚人的速度生長繁殖。它的遺骸沉積形成硅藻土。正是這種硅藻，通過光合作用向地球提供氧，促進了人類和動植物的誕生。硅藻土主要成分是硅酸質，表面有無數細孔，可吸附、分解空氣中的異味，具有調濕、除臭功能。采用硅藻土為原料生產出來的建材，不僅具有不燃、除濕、除臭和通透性好的特點，而且還能夠凈化空氣、隔音、防水和隔熱。